学术动态 您的位置:首页 > 学术动态 > 学术动态

唐开福团队在基因组学权威期刊《Genome Biology》上发表最新成果

作者: 时间:2019-04-15 21:45:13

近期,我室唐开福教授团队撰写的《Degradation of endogenous proteins an generation of a null-like phenotype in zerbrafish using Trim-Away technology》在基因组学权威期刊《Genome Biology》(五年平均影响因子16.5)上发表。

Trim-Away是德国马克斯普朗克生物物理化学研究所的Melina Schuh课题组和英国MRC分子生物学实验室的Leo James课题组于2017年发明的一种在细胞内快速降解特定蛋白的新技术。它利用Trim21和抗体来降解抗体的靶蛋白。Trim21是一种E3泛素连接酶,与抗体的Fc段结合后招募泛素-蛋白酶体系统来降解与抗体相结合的蛋白。与RNAi和基因编辑技术相比,Trim-Away技术可能在研究基因功能方面更有优势:RNAi和基因编辑技术需要较长时间(24小时甚至几天)剔除目标蛋白,这导致细胞有足够的时间建立代偿机制或产生继发效应;而Trim-Away技术则可以在15分钟内清除目标蛋白,细胞没有时间建立代偿机制或产生继发效应。

虽然Trim-Away技术可以在体外培养的细胞中降解目标蛋白,但是该技术在动物体内的应用尚无报道。用斑马鱼作为模式动物,唐开福教授团队发现Trim-Away技术可以在胚胎中降解目标蛋白。另外,本文还对morpholino和Trim-Away两种技术在斑马鱼胚胎发育研究中的应用做了比较。Morpholino是斑马鱼研究中常用的一种基因knockdown技术,它主要通过抑制mRNA翻译或剪接来抑制蛋白合成,但对已经存在于细胞中的蛋白没有影响,因此morpholino不能用来研究母源性蛋白(maternally contributed proteins)在胚胎发育过程中的功能。与morpholino不同,Trim-Away可以直接降解细胞内任何蛋白,因此可以用来研究母源性蛋白的功能。另外,morpholino需要几个小时甚至几天才能剔除目标蛋白,因此不能用来研究一个基因在胚胎发育早期(比如受精后2-3小时)的功能,而Trim-Away技术可以在十几分钟内剔除目标蛋白,所以可以用来研究一个基因在胚胎发育早期的功能。Trim-Away技术在诱导目标蛋白降解的同时也导致Trim21蛋白和抗体降解,但是当目标蛋白不表达时,Trim21蛋白和抗体可稳定存在于细胞中,因此在单细胞胚胎中注射Trim21和相应的抗体可以降解十几个小时以后才表达的蛋白。这一现象提示:Trim-Away不仅可以用来降解已经存在的致病蛋白,也可以用来预防致病蛋白的表达。

本研究得到了国家自然科学基金、浙江省自然科学基金以及温州医科大学附属第一医院的经费资助,还得到了兄弟单位温州医科大学基因组医学研究院等的无私帮助。

据悉,Genome Biology创刊于2000年,五年平均影响因子16.5,最新中科院JCR分区为1区。Genome Biology致力于从基因组及后基因组视角涵盖生物学和医学生物学的所有领域。文献类型包括Research, Method, Software, Review, Opinion和Commentary。部分经常覆盖的领域有基因序列分析,生物信息学,分子细胞生物学,功能基因组学,表观基因组学,群体基因学,蛋白质组学,比较生物学与进化,系统生物学,疾病基因组学和临床基因组学。

 untitled.png


友情链接:

地址:浙江省温州市瓯海区南白象温医一院新院区   邮编325000   电话:0577-55579309   邮箱: wmuklp@wmu.edu.cn

Copyright (c)2018 浙江省胰腺肝脏危重性疾病诊治新技术研究室(温州医科大学附属第一医院) 浙ICP备09016973号-4 技术支持: 捷点科技

浙公网安备 33030402000628号