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Nat Commun:科学家开发出特殊“框架”或能帮助确定癌症突变的时间

作者:生物谷 时间:2020-12-11 10:47:00

2020年12月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究癌症的进化开发出了一种特殊框架来帮助确定哪种工具组合最适合精确定位癌症基因组中DNA突变的确切时间。目前研究人员开发出了多种不同的算法来帮助确定突变的时间,但截止到目前为止,他们并不清楚到底哪种算法能够发挥最佳效应,以及哪些常见的偏差会影响所得到的研究结果。

图片来源:NIH

癌症是一种基因组疾病,随着癌症不断进展,其DNA会持续获得新的突变,而且癌细胞群也会持续不断进化,知晓其发生变化的顺序或能帮助研究人员随着时间研究癌症的进化并观察癌细胞群是如何发生多样化或者变得统一的。癌细胞群的多样化或均一性与患者对疗法的反应直接相关,同时这还能够揭示可用来开发高度靶向性疗法的易感性靶点。

文章中,研究人员评估了用于确定癌症基因组突变时间的22种不同的“工作流”(pipeline),同时在近乎300份临床前列腺癌样本中检测了这些算法,从而评估每一种“工作流”的工作效果并观察其产生的结果在各个方面的差异,这或许就能帮助研究人员观察到不同工具的差异性并对每一种工作得出一种公正的评价。

理解肿瘤转移的时间和原因,或其如何扩散到机体其它部位,或会影响癌症患者接受治疗的方式,本文中研究人员所开发出的框架或能帮助他们确定哪种工具应对具体病例更加准确,同时还能为治疗患者产生更为个体化的靶向性疗法策略,并能最大限度地降低癌症未来复发的风险或可能性。最后研究者Paul Boutros说道,后期我们还将会继续进行更为深入的研究来优化这种框架结构,从而使其能够更加有效地发挥作用,并帮助开发出治疗癌症的新型手段或策略。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Liu, L.Y., Bhandari, V., Salcedo, A. et al. Quantifying the influence of mutation detection on tumour subclonal reconstructionNat Commun 11, 6247 (2020). doi:10.1038/s41467-020-20055-w




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